Ausschalten über folgenden Eintrag in der /etc/rc.local:

rfkill block bluetooth

Bluetooth kann bei Bedarf über die entsprechende GUI wieder gestartet werden.

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Wenn die Bluetoothverbindung zu einem bereits gepaarten Gerät plötzlich streikt, kann die Verbindung mit folgendem Kommando zurückgesetzt werden:

sudo hciconfig hci0 reset

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